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Microbiologie 1

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baharicot's version from 2017-01-24 20:49

Introduction

Question Answer
La génération spontanée =l'apparition de microbes apd de la matière non vivante ou en décomposition
Postulats de koch - citer1) le micororganisme suspect doit être présent dans chaque cas de maladie, mais absent des organismes sains
2) le micro organisme suspect doit être isolé et cultivé en culture pure
3) la maladie doit se développer quand le micro organisme isolé est inoculé à un hôte sain
4) le même micro organisme doit être a nouveau isolé de l'hôte malade
Différence procaryotes p/r aux eucaryotes1) absence de noyau entouré d'une mbne, génome haploide
2) pas d'organites (granules ou vacuoles gazeuses)
3) pas d'endocytose
4) transcription et traduction ARNm couplée dans le cytosol
5) pas d'introns
6) structure ribosome + sensibilité aux AB
Différence virus p/r aux bactéries1) peuvent survivre qu'en infectant un organisme
2) reproduction autonome
3) petite taille
Dimensions E.Coli Diamètre de 1 à 1,5 µm et longueur de 2 à 6 µm
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Bactériologie

Question Answer
AutotropheBactérie transformant la matière minérale (CO2) en matière organique.
HétérotropheBactérie dégradant la matière organique, peut croître sur de nombreux substrats (ex. pétrole).
FermentationBactérie qui peut croître en l'absence d'O2 ou N2, dégradation de molécules complexes en éléments simples.
PrototropheBactérie capable de synthétiser les AA dont elles ont besoin.
AuxotropheBactérie incapable de synthétiser un ou plusieurs AA, devant le(s) récupérer dans son environnement.
PsychrophileBactérie capable de vivre à des températures basses (mois de 5 °C).
MésophilesBactérie vivant à un optimum de 37 °C.
ThermophilesBactérie vivant de 45 à 100 °C
Aérobie stricteBactérie nécessitant la présence d'O2.
Aérobie facultativeBactérie pouvant utiliser l'O2 mais pouvant aussi s'en passer (exemple fermentation).
Anaérobie aérotoléranteBactérie n'utilisant pas l'O2 mais en supportant la présence.
Anaérobie stricteBactérie ne survivant pas en présence d'O2.
Micro-aérophileBactérie nécessitant une pO2 bien précise (exemple dans l'eau, à une profondeur déterminée).
AcidophileBactérie supportant un pH très bas.
NeutrophileBactérie croissant à pH neutre ~ 7.
BasophileBactérie pouvant vivre jusqu'à un pH de ~ 10.
OsmotoléranteBactérie pouvant vivre dans des milieux à salinité très variée.
HalophileBactérie pouvant vivre dans des milieux extrêmement salées, jusque ~ 6 M NaCl.
BarophileBactérie nécessitant une pression jusque 400 atm.
CoqueBactérie de forme sphérique.
BacilleBactérie en forme de bâtonnet.
VibrionBactérie en forme de virgule, de quartier le lune.
SpirochèteBactérie en forme de long ver de terre.
Mycobactéries - 3 caractéristiques- bactéries Gram +
- paroi contenant e(en + du PG) des glycolipides (avec des acides mycoliques) et des peptidoglycolipides
- paroi contribue à la résistance du bacille de la tuberculose à la destruction par les lysosomes ou à la pénétration de certains AB
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Nutrition et croissance

Question Answer
Macro-éléments =carbone, oxygène, hydrogène, azote, souffre, phosphore, potassium, magnésium et fer
Oligo-éléments =manganèse, zinc, cobalt, molybate, nickel, cuivre
Phase de latence =bactérie adapte son métabolisme au milieu environnant et aux métabolites présents
Phase stationnaire = arrêt de la croissance par épuisement des ressources (diminution du métabolisme mais fonctions de transport de substrat maintenues)
2^x = a - que vaut x ? que vaut a ?x = nbre de générations, a = nbre de bactéries
Culture détectable de bactéries en turbidimétrie àpd ...10^7 bactéries/ml
Force proton-motrice =gradient de rpotons et un potentiel de membrane liée à la distribution inégale des charges
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Paroi

Question Answer
Différence Gram+ et Gram-1) épaisseur du peptidoglycane: 5-10 nm pour Gram- vs 80 nm pour Gram+
2) Gram- comprend une deuxième membrane, la membrane externe
Peptidoglycane - structure1) 2 sucres: acide N-acétylglucosamine et acide N-acétylmuramique
2) N-acétylmuramique fixé à 4 aa: L-alanine + acide D-glutamique + acide méso-DAP (Gram-) ou L-lysine (Gram+) + D-alanine
3) liaison pentagycine entre D-ala avec méso-DAP ou L-lysine d'une chaîne voisine
Rôle peptidoglycaneconfère rigidité + forme + résistance à la pression osmotique à la bactérie
Paroi Gram+ - 3 caractéristiques1) couche épaisse de peptidoglycane
2) bcp d'acides teichoiques (connectés direct au PG) ou lipoteichoiques (connectés direct aux peptides de la membrane) chargés -
3) protéines ancrées dans la MP via un motif d'ancrage
Paroi Gram – - 3 caractéristiques1) couche mince de peptidoglycane
2) PG entouré d'une membrane externe, constituée d'une double couche de phospholipides contenant le lipopolysaccharide (hydrophile)
3) Périplasme (espace entre MP et membrane externe)
Contenu du périplasme des bactéries Gram – ? (4 types de protéines!)1) enzymes dégradatives(nucléases, phosphatases alcalines, beta-lactamase)
2) protéines de transport
3) protéine DsbA: catalyse formation de PS et le repliement des protéines (périplasme = milieu oxydatif!)
4) PG donc aussi les protéines responsables de sa synthèse et de son entretien
Constitution du LPS (membrane externe) des Gram – (3 parties) ?1) partie lipidique - lipide A = endotoxine pouvant se lier aux TLR4 des macrophages ou des cellules dendritiques (inflammation grave)
2) partie polysaccharidique = noyau
3) partie saccharidique = quelques (3 à 5) oses linéaires ou branchés formant les antigènes somatiques, à la base des sérotypes des bactéries
Protéine la plus abondante constituant la membrane externe des Gram – ? + décrireLipoprotéine de Braun:
- ancrée dans la membrane externe par un acide gras N-terminal,
- son extrémité C-term est une lysine pouvant former un lien peptidique avec le méso-DAP du PG.
-> peut donc faire un lien entre le PG et la membrane externe.
Constitution de la mb externe des Gram- ?(1) LPS, (2) Lipoprotéine de Braun, (3) Mécanismes de transport (importation et exportation / sécrétion)
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Composants externes de la paroi

Question Answer
Capsule =couche supplémentaire à l'extérieur de la paroi, bien organisée.
Couche mucoide =couche supplémentaire à l'extérieur de la paroi, diffuse et pas enlevable facilement.
Couche S =couche supplémentaire à l'extérieur de la paroi, régulièrement structurée de protéines ou de glycoprotéines
Avantages d'une capsule (3)1) inhiber la phagocytose des bactéries par les macrophages ou les PMN
2) empêcher l'infection de la bactérie par un bactériophage
3) donner une résistance à certains agents antibactériens
Biofilm =communauté de bactéries renfermées dans une matrice extracellulaire qu'elles ont synthétisé, et qui les isole sélectivement du milieu extérieur.
Avantages d'un biofilm (2)protège les bactéries en diminuant l'accès aux AB et aux cellules phagocytaires
Flagelle - structure (3 parties)1) long tube formé par auto-assemblage de la flagelline
2) structure basale (ancrage du flagelle dans la bactérie) constitué d'un rotor qui fait tourner le flagelle à grande vitesse
3) crochet reliant le filament à la structure basale
Flagelle - expliquer le mouvement de propulsionplusieurs flagelles voisins tournant en sens anti-horloger (E.Coli) s'associent pour former des faisceaux en forme d'hélice et propulsent la bactérie.
Flagelle - expliquer le mouvement de culbutesplusieurs flagelles voisins tournant en sens horloger (E.Coli) poussent la bactérie à effectuer des culbutes
Chimiotactisme =mouvement des bactéries guidé par des substances attractives (éléments nutritifs comme sucres/aa) ou répulsives (substances indésirables).
Chimiorécepteurs =récepteurs de substances attractives/répulsives présents dans la membrane plasmique ou le périplasme.
Mode d'action des chimiorécepteursIls détectent le gradient de substance au cours du mouvement.
Quand le gradient est +, la bactérie se rapproche de la source attractive et se maintient en propulsion.
Quand le gradient diminue, la bactérie alterne le sens de rotation de ses flagelles.
La bactérie finit par se rapprocher de la substance attractive par un jeu de propulsion-éloignement.
Pilis ou fimbriae =appendices filiformes non locomoteurs.
Rôles des pili (2)1) permet à la bactérie d'adhérer à certaines surfaces (p.e les muqueuses ou l'épithélium intestinal humain)
2) pili sexuels impliqués dans le transfert de matériel génétique par conjugaison
Phages anti-mâles =pili sexues pouvant être exploités par des bactériophages comme récepteurs.
Spores - rôle ? propre aux Gram+ ou - ?propres aux Gram +, ils permettent de conserver le matériel génétique de la bactérie dans une structure extrêmement résistante aux conditions sévères (comme chaleur, radiations UV, désinfectants chimiques, dessication)
Spore - structure (5 couches!)1) endospore = cytoplasme + nucléoide très déshydratés
2) paroi
3) cortex = couche de PG peu ponté
4) tunique = deux tuniques constituées d'une couche de protéines proches de la kératine
5) exosporium = couche de lipoprotéines
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