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La transcription, la réplication (2)

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lisgr's version from 2016-06-25 16:17

La réplication de l'ADN

Question Answer
Réplication des mitochondries / chloroplastesidentique ) la réplication bactérienne
3 étapes dans la réplication bactérienne1) réplication de l'ADN 2) partition des constituants du cytoplasme 3) division en 2 cellules
1ère étape dans la réplication de l'ADNhélicase casse les liaisons H
2ème étape dans la réplication de l'ADNsynthèse ddes amorces d'ARN
Substrat de la réplicationnucléotides triphosphates
Matrice de la réplicationle brin opposé
amorce de la réplicationamorce d'ARN
Énergie de la réplicationles deux Pirophosphate inorganiques (PPi) libérés des dNTP
Origine de la réplication procaryoteOri, qui est au centre de l'oeil de réplication
progression des fourches de réplicationdans les deux directions à partir des Ori,
les enzymes qui interviennent lors de la réplicationADN polymérase (NRJ, PAR LES PHOSPH), hélicase (NRJ, ATP), parfois topoisomérase (TYPE II, NRJ ATP), ARN primase , ADN ligase (ATP)
Sens de synthèse des amorces d'ARN5' -> 3'
Problème de réplicationle brin orienté 3'> 5' n'aura pas de pb, l'autre aura des fragments d'okasaki
Fragments d'oKasaki, fonctionnementla primase refait des amorces, avant sur le brin
Synonymes de fragments d'okasakibrin retardé
Qui remplace l'amorce des fragments d'oKasakil'adn polymérase lorsqu'elle continue sont chemin
Les ADN pol sont identiques pour les fragments avancés et retardésFaux
Qui lie les fragments d'Okasaki entre euxl'adn Ligase
Qui supprime les amorcesune enzyme qui lyse, puis adn pol, remplace
Répliconmorceau d'adn se répliquant à partir d'une ORI
Qui polymérise l'ajout des nucléotides lors de la réplicationADN polymérase
Qui synthétise les amorces d'ARNARN primase
l'ADN polymérase assemble l'adn à partir de ribonucléotides ??FAUX, à partir de désoxyribonucléotides
Les amorces d'ARN sont posées par l'ARN polyméraseFAUX, par l'ARN primase, la polymérase sert à la transcription
prenons maladie méthylée chez les hommes, un homme x est porteur de l'allèle muté, (il ne l'exprime pas car muté), il transmet à sa fille (elle n'est pas malade), quel est le pourcentage que cette fille transmette à ses enfants la maladie50%, car son conjoint aura forcément méthylé ce gène, tout dépendra de la femme
Différences réplication eucayote procaryote1° molécule linéaire, pas circulaire 2) départs multiples (milliers réplicons) qui fusionnent par la suite 3) synthèse histones
Quand se produit la réplication de l'ADNen INTERPHASE durant la phase s, il y a également formation de nouvelles histones
Différence chromatine et chromatidechromatine, juste nucléosomes qui sont reliés / H1, état relaché. Chromatide, condensé
Après la réplication, agencement des molécules d'ADNles 2 molécules identiques restent associées par des cohésines qui lient les histones = forme des chromatides,
Télomère contiennent des gènesFAUX, n'ont pas de gène, mais une séquence répétitive
Télomères, extrémitéextrémité 3' en extension de 20 à 200 nucléotides
télomères, structureboucle télomérique avec l'extrémité 3'avec des protéines protectrices
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la transcription

Question Answer
Le nombre de gène codant pour les différents types d'arn/ Comparé à la diversité des ARN20 000 gènes pour les ARNm, donc les protéines, et 10 000 pour les autres ARN. les ARNr, et t sont les plus nombreux, mais les ARNm sont plus nombreux en terme de diversité
Différents types d'arn R5S, 5.8S, 18S, 28S
Première étape de la transcriptionséparation des deux brins par l"hélicase
le brin positifle brin 5' -> 3', le brin identique à l'ARN
Le brin négatifle brin 3' -> 5', modèle, matrice, complémentaire à l'Arn
Nombre de matrices réplication / transcriptiondans le réplication les 2 brins servent de matrice (brin retardé, brin avancé), dans la transcription que le brin - qui sert de matrice
Sens de la transcription5' -> 3'
Enzymes qui interviennent durant la transcription1) hélicase, 2) ARN polymérase (pas de primase, pas de ligase)
Qui met les amorces lors de la transcriptionPERSONNE, pas d'amorces
Substrat de la transcriptionNTP (pas des dNTP)
NRJ de l'ARN polphosphates inorganiques
Différents types d'arn POL1 seul pour les bactéries pour les ARNm, r et t , 3 types pour les eucaryotes
ARN pol Ipour les ARNr (5.8S, 18S, 28S)
ARN pol IIpour les ARN m et les micro-ARN
ARN pol IIIpour les ARNt, et ARN r5S, et les petits ARN nucléaires
Début de transcription pour les eucaryotes30 nucléotides après la boite TATA OU sur séquence Inr (selon le promoteur) / ou si indiqué par les scientifique, au premier exon
Les promoteurs connus (eucaryotes / procaryotes )Boite TATA, séquence Inr, boite de Pribnow, TTGACA
Ou est située la boite TATAenviron 30 nucléotides avant le début de la transcription (site +1)
Qui se fixe sur la boite TATATBP, tata binding protéine
TBP actionse fixe sur la boite TATA et intéragit avec des FACTEURS GÉNÉRAUX de la transcription qui se fixent à l'ARN pol II, et lui donnent le signal pour commencer la transcription
Le premier nucléotide transcrit la plupart du temps chez les eucaryotesun A, situé au site +1 (une adénine)
Alternative à la boite TATAInr, ou initiateur
Comment Inr permet la transcriptionles facteurs généraux de la transcription se fixent DIRECTEMENT sur la séquence (pas TBP) et se lient à ARN pol II
Ou est située la séquence INRsur le site +1 donc la transcription commence au premier A de la séquence Inr,
La séquence InR fait partie de la séquence transcrite par ARN pol IIVRAI
Début de la transcription procaryoteBoite de Pribnow, ET TTGACA
Ou est située la boite de Pribnow10 nucléotides avant le site +1
Ou est située la boite TTGACA35 nucléotides avant le site +1
2 types d'expression1) ubiquitaire, dans toutes les cellules 2) spécifique
D'autres facteurs qui régulent la transcription des gènes1) les facteurs TRANS: les FACTEURS DE TRANSCRIPTION (PAS GÉNÉRAUX), ils sont spécifiques à des gènes 2) les facteurs CIS: séquence promoteur, silencer .. .
Séquence Cisséquence ADN qui module l'expression des gènes (enhancer, silencer, promoteurs)
Séquence transfacteur de transcription spéciiques qui se fixe sur l'ADN
Promoteur, localisation - tailleTOUJOURS avant l'exon 1, qqs centaines de PB et comprennent la séquence tata, ou Inr ...
Enhancers, silencers - localisation, tailleAvant ou après le promoteur, peut parfois être à grande distance de lui
Qui se fixe sur les promoteurs / les enhancers / les silencersles FACTEURS SPÉCIFIQUES de transcription, ils ont une séquence SPÉCIFIQUE cis concensus. Et agissent soit sur ARN pol II, soit sur les facteurs généraux
Consitution des facteurs de transcriptionprotéines modulaires constituées de plusieurs domaines différents: 1) fixation à la séquence concensur 2) transactivateur ou répresseur de ARN pol II
P53exemple de facteur de transcription, avec 1 domaine de fixation, un domaine activateur, un domaine de tétramérisation
p53rôle: mort cellulaire programmée
Combien de facteurs de transcriptions chez l'humain+- 1000
P53 et son site de fixationa 2 domaines de fixations (2 fois le même modèle) et rconnait donc des séquences répétitives
1 facteur de transcription contrôle 1 seul gèneFAUX, chaque facteur contrôle une trentaine de gène.
Combinaison de facteurs de transcriptionle promoteur de chaque gène varie: combinaison unique de séquences CIS, donc combinaison unique de facteurs spécifiques de transcription
Quels sont les différents types de facteurs de transcription spécifiques1) activateurs et stimulent la transcription 2) répresseurs et répriment la transcription
Comment agissent les facteurs de transcription spécifiques1) soit effet direct sur ARN pol 2) soit effet sur les facteurs généraux de transcription
Comment les histones font ils pour moduler la transcriptionles histones lient des facteurs de transcription spécifique (répresseurs ou activateurs) qui vont compacter la chromatine ou la détendre
Quels sont les facteurs de transcription se fixant sur les histones en l'activant1) FT activateur qui amène HAT: histone acétyl transférase 2) FT répresseur qui amène HDAC hystone désacétylase
Rôle de HATacétyler le shistones = relâche et permet la transcription, sont activées par facteur de transcription
Rôle de HDACdésacétyler et compacter, empêche la transcription, activée par facteur de transcription
Acétylation de la lysinel'histone a une queue n terminale, qui se termine par une lysine, on enlève NH3+ de la lysine pour mettre CO-CH3, ce qui diminue le nombre de charges + -> décolle de l'ADN
Les enzymes qui acétylent les histones interviennent seulesFAUX elles ont besoin d'être "activées" par un facteur de transcription spécifique qui se fixe spécifiquement à la séquence d'ADN
Activité des facteurs de transcription - selon le moment d'action1) constitutive= actif en toute circonstance 2) inductible, actif lors d'un stimuli
Activité des facteurs de transcription - selon le type de cellules1) ubiquitiste: exprimés dans tous les types de cellules 2) histo spécifique, dans un seul type
Différence principale entre facteurs généraux de transcription, et facteurs spécifiques de transcriptions1° les généraux déterminent le lieu ou commence la transcription 2) les spécifiques déterminent si le gène va être transcrit et en quelle quantité
Fonctionnement de la régulation des hormones dans le corpssouvent, les hormones, dans le cyto se fixent à une protéine spécifique, et entrent dans le noyau et jouent elles même un rôle de "répression" de la transcription
Il y a toujours autant de départ de transcriptions que de promoteurs ?vrai
il y a autant d'ARN m différents que de promoteursVRAI
Exons mutuellement exclusifsexons qui ne peuvent exister ensemble dans un ARNm, pour cela on utilise des promoteurs alternatifs (d'un tissu à l'autre)
Des protéines issues de promoteurs alternatifs sont forcément différentesFAUX, dépend du commencement de l'AUG (Si exon 1a, et 1b, et AUG commence dans l'exon 1, oui elles seront différentes)
es protéines issues de promoteurs alternatifs sont COMPLÉTEMENT différentesfaux, le cadre de lecture n'est souvent pas décalé ce qui en fait des protéines presque identiques
Fin de transcription bactériesséquence palyndromique suivie d'une série de u (épingle cheveux)
Fin de la transcription eucaryotesite de polyadénylation: AAUAAA
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