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GENETIQUE -Abbréviations

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Noms Complets et Abbréviations

Question Answer
LINELong Interspersed Nuclear Elements
SINEShort Interspersed Nuclear Elements
LTR Long Terminal Repeats
STRPShort Tandem Repeat Polymorphism
VNTR Variable Number of Tandem Repeat
SNPSingle Nucleotide Polymorphism
CNPCopy Number Polymorphism
CNV Copy Number Variation
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Définitions d'abbréviation

 

Question Answer
LINEGroupe d'éléments génétiques retrouvés en grand nombre, faisant partie des motif modérément répétitifs, dans le noyau des cellules eucaryotes
LINE-1Ou L1. Seul élément LINE actif
SINEPetites séquences d'ADN répétées un grand nombre de fois (motif modérément répétitif)
AluSINE le plus abondant chez l'humain, identifié par l'enzyme de restriction Alu.
LTRSéquences nucléotidiques de petites tailles, répétées dans le génome et constituant souvent les extrémités 3' et 5' des transposons. On le retrouve dans les rétrotransposons et l'ADN des rétrovirus
TransposonsElements mobiles constitués d'une séquence d'ADN pouvant se déplacer dans le génome et éventuellement l'altérer.
STRP/ VNTRRépétition en tandem, les unes à côté des autres dans le locus ce qui entraîne les erreurs de la polymérase. Cause de variabilité.
SNPVariation d'un seul nucléotide dans une séquence entre individus d'une même espèce. Cause 90% des variations génétiques humaines.
CNP/CNVPolymorphisme du nombre de copies d'un locus.
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Pourcentages, probabilités

 

Question Answer
LINEEnviron 22% du génome humain
SINE10% du génome
LTR8% du génome
Transposons3% du génome
STRP/VNTR Moins de 5% du génome
SNP1 toutes les 100 à 300 pdb en moyenne
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