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Gene-Génomes & Réplication ADN

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mndyass's version from 2017-03-23 14:58

Gènes & Génomes-Définitions

 

Question Answer
GeneSegment d'ADN contenant info. pour production ARN
LocusEndroit ou l'on trouve un gène spécifique
GenomeEnsemble dru matériel génétique d'une espèce
Genome bacteriaMolécule cyclique + Plasmide
Genome EucaryoteCouper en 23 parties
Deux copies (Diploïde)
Forme Chromatine
Nombre de gènes chez Bactérie4000
Nombre de base/gene chez Bactérie1000
Séquence non-codante-Introns
-Région Intergéniques
-Hétérochromatine
-Régions Répétitives
Sequence non-codante chez les bactériesn'en ont pas ou très peu
Séquence non-codante chez humainsAugmente avec le temps, ne code pas les protéines mais nécessaire
Séquence Inter-Genique+ d'introns => Genomes + grand => moins codé
ChromatineADN plus compact
Taille noyau Eucaryote5-10 micromètres
Un nucléosome =8 Histones + 1 molécule d'ADN
HistoneProtéine autour de laquelle s'enroule l'ADN
Enroulement ADN de combien de tour autour histone1 tour & 2/3
Pourquoi cette enroulementSert de protection + Rendre plus court pour entrer dans la cellule
Combien de sorte d'histone5 types =>
H1-> Lie les different morceaux de chromatine
Les 4autres -> Corps de nucléosome (H2A;H2B;H3;H4)
Combien d'histone8 histones 2par2 => 2molécules de chaque
Diametre fibre de chromatine30nm
Charge HistoneChargé positives (17 +a pH 7)
Comment neutraliser les chargesAugmenter pH
Point isoélectrique histone11,5
Expliquer les chargesADN est chargé négativement, alors que l'histone positivement, ce qui crée attraction
Conservation des histonesSuper bien conserver peu importe les différentes espèces, toujours +/- pareil (chez eucaryotes)
Numérotation du chromosomeDu centromère au télomère
Cité les 2 bras du chromosomes-Bras Long Q
-Bras Court P
Numérotation des chromosomesSe 1 à 22 + grand au + petit;
On finit par X (grand) & Y (petit)
Combien de gene répertorié35.000 =>
->20.000 ARNmessager codent polypeptides
->15.000 ARN non-codants régulateurs et structuraux
Bandes chromosomiquesBandes noirs et blanches que l'on voit
=> On peut sur leur base définir le gène
Définit sur base du brin +/- & séquenceOn connait l'anomalie, la différence chez chaque chromosomes, suffit de chercher l'anomalie et on sait définir le gène
Numérotation des brinsDu 5' vers 3'
Bras Court -> Bras Long and
ADN humain nombre de base3,2milliards de paires de base = 0,9m d'ADN
Combien de copie ?2 fois donc 1,8m d'ADN
Combien de molecules d'ADN différentes24 => 22 autosomes & X & Y
Génome MitochondrialeTrès petit mais non négligeable
Genome mitochondrial encode combien de ARNm13 ARNm et qlq genes
ARNm du G. Mitochondrial sert àMachine respiratoire
Systeme du G. Mitochon.Systeme autonome
Heritage de qui ?De la mère uniquement
Genes Orthologue-Conservés au cours de l'évolution
-Jouent même fonction
-Présentent une homologie de séquence
ex. Cytochrome C
Genes ParaloguesProteines homologues vent du même organisme
Forment une familles de gènes dans une même espèce
même fonction et séquence homologue
PseudogènesSequences homologue
Non-codant
Representent reliquat de l'evolution => Genes prologues au depart ayant subit mutation
=>Restes "inutiles" de l'évolution
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Réplication de l'ADN

Division Procaryotes

 

Question Answer
Molecule d'ADN synthétiser sur base de ?Molécule d'ADN
ExceptionRetrovirus => Sur base d'ARN
Division des Procaryotes-Replication de l'ADN circulaire
-Partage équitable des constituants cytoplasme
-Division en 2 cellules filles
Semi-ConservativeToutes molecule d'ADN = 1 brin existant et 1 brin d'ADN crée
Séparation des brinsEn 2 étapes
Etape 1 expliquerSéparation par Hélicases
HélicaseEst une enzyme pour séparer les brins
Etape 2 expliquer-1°Synthèse 2ème brin dans le sens 5'->3'
-2°Réplication
RéplicationQuand on a les 2 molécules identiques
ADN PolymeraseSynthétise le nouveau brin => Proteine
Qui sert de matrice ?1er brin
Qui sert de substrat ?Nucléotides triphosphatés
Pourquoi 3Phosphates2 vont fournir l'énergie nécessaire et un va être utiliser dans le brin
PrimaseCommence le travail pour la réplication (ARN)
Amorce d'ARNDébut par Primase, va être exclu
Origine de replicationDépart toujours le même
Fourches de replicationsEndroit ou travail l'ADN polymérase
Crée avec la rupture de lien H Grace a l'ADN Hélicase + Energie ATP
TopoisomérasePeuvent intervenir pour défaire les surenroulement
SensAllonge extrémité de 3' (donc 5'->3')
Combien d'ADN Polymérase2; une sur chaque brin
Brin 3'-5' Comment faire ?L'ADN Polymerase se fixe sur une autre amorce d'ARN poser par ARN Primase
Fragments d'OkasakiPetis bout de brin synthétiser et séparer ( sur brin inverse)
ADN LigaseLie les brins d'ADN d'Okasaki entre eux
RépliconEspace entre les deux brin, l'endroit ou est entrain de se faire la réplication
2 type de brin sur le repliconCeux qui suivent les fourches sur un brin et sur l'autre => Brin avancée
Fragment d'Okasaki comme vue en haut pour l'autre partie
Propriétés de l'ADN Polymérase
(5Points Important!)
-Fabrique ADN bicentenaire a partir d'ADN monocaténaire + Respecte complémentarité bases
-Allonge extrémité 3' -> de 5'-3'
-Besoin d'une amorce
-Utilise dNTP desoxynucléotides (dTTP, dATP, dGTP,dCTP)
-Energie = Hydrolyse du PPi libérer par transfert dNMP
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Replication Eucaryote

 

Question Answer
Difference avec les bactéries-ADN linéaire
-Départ multiples; Millier de Réplicon qui fusionnent ensuite
-Synthèse nouvelles histones & reconstitution chromatine
-Problème télomères
Phase de réplication ADNInterphase
Interphase sépare en-Gap1(G1) => Premier Hiatus
-Phase de synthèse ADN
-Gap2(G2) => Second Hiatus
CohésineFait que les molécules d'ADN restent associées après réplication
ChromosomeCondenser de chromatine durant la prophase
Boucle télomériqueStructure secondaire des télomeres
Protege la structure
Télomeresextrémités sans gènes, ne codant rien
Longueur des télomeres20 à 200 nucléotides
Sequence des télomèresRepetition TTAGGG
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Epigénétique

 

Question Answer
EpigénétiqueEtude des changement héréditaire dans l'expressions
-Modification des bases de l'ADN
-Modification des histones lors de la transcription
Bases modifiées ADNFixation méthyle (CH3)
Fixation méthyle sur quel C ?5'd'une cytosine
Cytosine + Methyl5-Méthyl-Cytosine
5-Méthyle-CytosineStructure intermédiaire entre cytosine & thymine
Méthyl intervient-il dans appariement entre bases C & G (justifier)Non, N'intervient pas avec les 3 ponts hydrogènes
Qui a des traces de methyl cytosineTous les êtres vivants
Methyl chez les vertébrésDe manière symétrique (cytosine suivit directement d'un G)
Y a t-il 1/16 de CpG ?Non, au cours de l'évolution perte du a deamination & oxydation = Dénaturation pour devenir Thymine
Les CpG sont-elles repartie de manière aléatoire ?Non, sous forme d'ilots en général (ilots non méthylé) et 1% éparpiller (méthylé)
DNMT veut direDNA MethylTransferases
DNMT sert àCatalysé la réaction de méthylation
Méthylation induit 2 processus-Changement structure chromatine =>Forte compactation rendant segments ADN concernés inutilisable
-Repression transcription => Empêche fixation facteurs de transcription sur ADN
Genes méthylé est-il silencieux ?Oui quoi qu'on fasse il est silencieux
Fonctions de la méthylation de l’ADN (4) A) Régulation de l’expression des gènes en fonction du type cellulaire
B) L’inactivation d’un des deux chromosomes X chez la femme (Corpuscule de Barr)
C) Les gènes soumis à l’empreinte parentale
D) Inactivation des séquences répétitives du génome
Gènes transcrits-5000 à 10000 gènes
-chromatine ouverte, donc utilisable
- îlots CpG non méthylés
-facteurs de transcription peuvent se fixer sur promoteurs/enhancers
Gènes non transcrits/silencieux- 20000 à 25000
-chromatine compactée, car inutile ( gain de place )
- îlots CpG méthylés
-facteurs de transcription réprimés.
Mosaique de cellulesChromosomes X femme qui fonctionne a 50%-50%
Quest ce qui permet inactivation d'un chromosome X ?C'est la méthylation
Quand est ce que le 2eme X est deméthylé ?Lors de l'ovogenèse
Empreinte parentale=Méthylation différentielle selon qu'un même gène soit transmis par spermatozoïde ou ovule
Loi pour maladie causé par empreinte parental-Allèle mutée transmise selon Mendel 50%/Allèle
-Expression du gène devient monoallelique du fait de l'empreinte parentale
Condition pour être malade-Porteur de l'allèle mutée
-Recevoir cet allèle du parent ne méthylant pas le gène
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