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Biomol-ADN

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mndyass's version from 2017-03-20 12:46

Acides Nucléiques

 

Question Answer
QuoiPolymères
CombienJusque 100 000 000 unités
OuDans le noyau cellulaire principalement
Pourquoi structure solubleGrace au groupement Acide
Nucléique suggèreADN & ARN sont ubiquitaires dans le noyau cellulaire
Ou peut-on trouver de l'ADN-Noyau principalement
-Mitochondries
-Plastes des cellules eucaryotes
Ou peut-on trouver de l'ARN-Noyau principalement
-Cytosol
Que porte la structure principale-Phosphate
-Base azotée
-Sucre
Numérotation des carbonesDe 1' à 5' ;
-En commençant par le carbone portant la base azoté
Sens inverse aiguilles d'une montre
Différence entre la structure ADN & ARNLorsque sur le Carbone 2' on a H->ADN;
Si on a OH->ARN
Condensation acides nucléiquesPar formation d'un lien phosphodiester cavalent
Lien phosphodiesterPerte d'une molécule H2O
+Phosphate lie par 2 liens ester les molécules
Liaison entre 2 molécules A. Nuc. entrePhosphate de C5' et Alcool C3'
Orientation conventionnellePhosphate -> Ribose => 5' -> 3'
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Bases des nucléotides

 

Question Answer
2 Familles de bases faibles-Puriques
-Pyrimidiques
PurineStructure mère des bases Puriques
PyrimidineStructure mère des bases Pyrimidiques
Structures des bases azotéAromatique Plane + Double liaisons conjugués
Structure PurineBiciclique
Structure PyrimidineCyclique
5 Variantes retrouvé dans les A. Nucl.-2 Puriques
° Adénine A
Guanine G (ADN & ARN)
-3Pyrimidiques
°Thymine T (ADN)
°Uracile U (ARN)
°Cytosine C
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Base Puriques

 

Question Answer
Changement Adénine-H -> NH2
Tautomère AdénineImine & Amine = Equilibre
Imine => H de NH2 -> N + rupture de =NH
Amine => forme connu
AmineMajoritaire
Changement Guanine-H -> =O
-H -> NH2
Tautomères GuanineCéto & Enol = Equilibre
Céto => Forme connu
Enol => Rupture =0 -> OH grâce au H de N
Forme Céto donneAmide N-C=O + Rependue
Tautomere Céto =Cetone
Tautomere Enol =Alcool
Elimination bases puriquesAcide Urique
Acide urique+Soluble dans l'eau
Forme acide uriqueCéto & Enol
Acide urique forme à pH physio.Urate
UrateEtape final catabolisme des bases puriques
Mauvaise élimination urate conduit -> problème de santé
Par formation de cristaux dans la vessie ou art.
Problème de l'urate+Soluble
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Bases Pyrimidiques

 

Question Answer
Dérivé4 existante => 3 étudier
Fonction communeC=O
Difference T & UCH3 sur C5' de T
H sur C5' de U
2ème nom ThymineMéthyl-Uracile
Liaison possibleA-T & A-U
5-Méthyl-Cytosine=Cytosine avec C5' portant un Méthyl a la place d'un H
Liaison possibleG-C & G-5-méthyl-Cytosine
Tautomérieidem que Puriques
Base liée à 1 sucre uniquementnucléoside
Base liée à 1 sucre & 1 ou + phosphates nucléotide
Max. de phosphates sur un nucl.-1= Monophosphaté (NMP)
-2= Diphosphaté (NDP)
-3= Triphosphaté (NTP)
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Structure de l’ADN

 

Question Answer
Expériences d’E. ChargaffPouvoir quantifie précisément quantité d'ADN ou d'ARN
mycobacteriumBacteries causant pneumonie importantes
% de C & GConstant au sein d'une même espèce
Répartition en divers nucléotides % de C+G+/- 40% pour l’homme
Structure ADNHélicoïdale
Appariement complémentaire des basesUne base purique + base pyrimidique
Appariement due auxPonts hydrogène
Ponts hydrogène sont des liaisonsnon-covalentes
T ou U se lie à A par 2 ponts hydrogène
C et G par3 ponts hydrogène.
Les brins d’ADN sont dans un sensantiparallèle
Taille double hélice ADNHélice de 3,4 nm
10,4 nucléotides/Tour
Composant et disposition-Phosphate & sucre à l'extérieur
-Bases emboités les unes aux autres
Pourquoi C-G + SolideCar 3 ponts hydrogène
Double-hélice présente distorsions appeléessillons majeur (élargissement) angle de +180°
& mineur (rétrécissement) angle de -180°
Sillon + favorableSillon majeur; facilité aux molécules de se lier
ADN circulaire uniquement dansMitochondries
SuperhéliceStructure tertiaire de l'AND
molecule super grande s'entour sur elle même
SupertortionCorrespond au nombre de superhélices, de "boucle" on fait
Abréviation de TorsionT
Abréviation SupertorsionW
T+W=Constante L
LNombre d'enlacement (= de fois que le brin tourne autour de l'autre)
1 tour de pas droite =+1 sur L
1 tour de pas gauche =-1 sur L
Processus de réplication de l’ADNOn casse 1 brin
Rupture d'un brin effetIntroduction d'une supertorsion
Rupture de 2 brins =2supertorsions
Superenroulement indispensable carLes molécules trop grandes ne rentrerait pas dans les cellules
Rupture par l'enzyme notétopoisomérases
TopoisomeraseEnzyme Polypeptidiques modifiant surenroulement de l'ADN
indispensable pour réplication ADN
Topoisomerase & antibiotiqueCiprofloxacine ciblent enzymes bactériennes
Topoisomerase & anticancéreuxDoxorubicine Ciblent les enzymes humaines
Denaturation consequence-Rupture ponts hydrogènes
-Conservation liaisons covalences
Facteur de denaturation-Température
-Liaisons G-C + stable que A-T
Longueur de la chaine
-pH environnement
-Composition ionique
-Agents Chaotropiques (cassent ponts H)
Temperature de fusion (Tm)-50% ADN sous forme bicaténaire
50% ADN sous forme monocaténaire/dénaturée
Séquence PalindromiqueCapable de se coupler avec elle-même
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Comparaison entre l’ADN et l’ARN

 

Y.ADNARN
Fonctions respectivesgénome synthèse protéique
Temps de vieToute une vie (au-delà parfois) Qlq minutes, heures
Groupement-H-OH (ce qui rend fragile)
A. nucl.UT
SucreDesoxyriboseRibose
StabilitéElevéeFaible
Longueur10exp.4 - 10exp.820 - 10exp4
StructureBicaténaireMonocaténaire
Nombre A. Nucl.Paires Bases
-Kilibase (Kb) = 10exp.3b
-Mégabase (Mb) = 10exp.6b
-Gigabase (Gb)
Bases 10exp.9b
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ARN

 

Question Answer
Effet de l'alcool en 2'Attaque nucléophile milieu basique
Attaque nucléophile donneEster phosphate cyclique
HydrolyseProvoque deuxième attaque nucléophile
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> Pas stable

Structure secondaire de l'ARN et grandeurs

 

Question Answer
Double hélice d'ARNPossible, si on le fait de manière volontaire (en labo)
Structure secondaireSi il s'apparait avec lui même
Ou les trouverRare; + génome de certain virus (ex. Rotavirus)
Sequence ARN s'apparait avec elle mêmeSéquence palindromique
Taille génome humain3Gb (gigabases)
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