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Biologie cellulaire 2

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baharicot's version from 2016-12-30 07:30

Signalisation

Question Answer
EGFRRécepteur à l'EGF (facteur de croissance).
Érythropoïétine (EPO)Hormone stimulant la synthèse des érythrocytes. Cytokine, traitement de l'anémie.
Thrombopoïétine (TPO)Hormone stimulant la synthèse des thrombocytes. Cytokine, traitement de la thrombocytopénie.
JAKTyrosine-kinase extrinsèque, recrutée par un récepteur et activant STAT par phosphorylation.
TGF-βRécepteur sérine/thréonine-kinase.
BMPRécepteur sérine/thréonine-kinase.
β-caténineProtéine soluble impliquée dans la morphogenèse, régulée par ubiquitinylation (axine et APC).
Triiodothyronine(= T3) Hormone hydrophile dérivée de la tyrosine tri-iodée.
Thyroxine(= T4) Hormone hydrophile dérivée de la tyrosine tétra-iodée.
CortisolHormone hydrophile dérivée du cholestérol = hormone de stress.
AldostéroneHormone hydrophile dérivée du cholestérol, contrôle de réabsorption du sodium.
ProgestéroneHormone hydrophile dérivée du cholestérol, contrôle de la grossesse.
TestostéroneHormone hydrophile dérivée du cholestérol, hormone masculinisante, précurseur de E2.
Estradiol (E2)Hormone hydrophile dérivée du cholestérol, hormone féminisante et contrôle de la grossesse.
Vitamin D-binding protein (DBP)Petite protéine transportant la (pro)vitamine D dans le sang, dégradée par les lysosomes dans le rein.
AMPcsecond messager hydrophile, active une protéine kinase A.
GMPcsecond messager hydrophile, active une protéine kinase G.
Diacylglycérol (DAG)second messager hydrophile, active une protéine kinase C.
Inositol-1,4,5-trisphosphate (IP3)second messager hydrophile, ouvre les canaux Ca2+ du REL.
Adénylate cyclaseEnzyme catalysant la réaction ATP --> AMPc.
PhosphodiestéraseEnzyme catalysant la réaction AMPc --> AMP. Inhibée par la théophylline (dérivé de la caféine).
RasProtéine G membranaire recrutée par EGFR, activée lorsqu'elle est liée à GPT. Recrute Raf.
RafMAPKKK, facteur recruté par Ras, capable de phosphoryler MEK.
MEKMAPKK, activée lorsqu'elle est phosphorylée par Raf, capable de phosphoryler ERK.
ERKMAPK, activée lorsqu'elle est phosphorylée par MEK, capable de phosphoryler divers effecteurs nucléaires induisant la mitose.
IRS1Protéine recrutée par phosphorylation par le récepteur à l'insuline (InsR). Peut phosphoryler PI3K.
PI3KProtéine kinase recrutée par phosphorylation par IRS1, phosphoryle le phosphatidylinositol pour donner l'IP3.
STATRecrutée par phosphorylation et dimérisation par JAK, peut ensuite entrer dans le noyau et jouer le rôle de facteur de transcription.
Interféron alphaCytokine, traitement de la leucémie et des infections virales.
Interféron bêtaCytokine, traitement de la sclérose en plaques cyclique.
WntProtéine signal dont le récepteur recrute l'axine, libérant la β-caténine qui pourra jouer le rôle de facteur de transcription.
DeltaRécepteur de la signaling cell.
NotchRécepteur de la responding cell.
ADAMProtéase clivant le récepteur notch dans sa partie extracellulaire.
Gamma-sécrétaseProtéase clivant le récepteur notch dans sa partie intracellulaire.
APCProtéine empêchant l'activation de la β-caténine. Mutée, peut induire la polypose familiale.
APPAmyloïd Precursor Protein, protéine de surface pouvant être clivée par la gamma-sécrétase et induire la maladie d'Alzheimer.
ThéophyllineDérivé de la caféine, inhibe la phosphodiestérase et donc augmente la concentration de l'AMPc, avec un effet excitant.
β-mimétiqueMolécule imitant l'effet de l'adrénaline dans les récepteurs β, augmentant l'activité de l'adénylate cyclase et donc la [AMPc], avec un effet excitant.
Toxine du choléraToxine activant Gsa, induisant l'activation constitutive de l'adénylate cyclase.
Toxine de la coquelucheToxine inhibant Gia, induisant l'activation constitutive de l'adénylate cyclase.
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Endocytose

Question Answer
Endosome précoceCentre de tri et recyclage de la membrane et des récepteurs.
Endosome tardifCorps multivésiculaire, pH ~ 5.
LysosomeAcidification (pH ~ 5) et hydrolases acides digérant les protéines, lipides…
ChloroquineBase faible pouvant traverser les membranes et se protoner dans les compartiments acidifiés (lysosomes), neutralisant le pH et les faisant gonfler par surcharge osmotique.
TriskélionMolécule de clathrine à trois bras, composée de 3 chaînes légères et 3 chaînes lourdes. 36 triskélions forment une vésicule.
DynamineProtéine polymérisant autour du col de la vésicule pour libérer celle-ci du reste de la membrane plasmique. Utilise du GTP.
COP ITransport du Golgi vers le RER.
COP IITransport du RER vers le Golgi.
RabProtéine capable de rapprocher deux membrane avec Rab effector. Utilise du GTP. Plusieurs types spécifiques selon la cible ( > 30 différents).
Complexe SNAREComplexe protéique de fusion entre la vésicule (v-SNARE, exemple VAMP) et la membrane de la cible (t-SNARE, exemple syntaxine).
NSFProtéine induisant la fusion des membranes de la vésicule et de la cible et désassemblant le complexe SNARE. Utilise de l'ATP.
DynéineProtéine transportant les organites (vésicules…) vers l'extrémité - des microtubules (centre de la cellule).
KinésineProtéine transportant les organites (vésicules…) vers l'extrémité + des microtubules (périphérie cellulaire).
LDLRRécepteur des LDL "fraîches" (non oxydées), fortement régulée par le système d'homéostasie du cholestérol cellulaire.
LRP-1Récepteur des LDL "vieillies" (oxydées) et autres protéines indésirables dans les macrophages.
Facteur intrinsèqueProtéine de transport de la cobalamine (vitamine B12), synthétisée par la muqueuse gastrique et réabsorbée dans l'iléon avec la vitamine.
FerritineProtéine permettant le stockage du fer dans le cytosol.
IgAImmunoglobuline A, sécrétion.
IgGImmunoglobuline G, plasma sanguin.
TSHThyroïd Stimulating Hormon, produite par l'hypophyse et induisant la synthèse de T3 et T4 dans la thyroïde.
APCAntigen Presenting Cell (macrophage, cellule dendritique).
MHC-IIProtéine s'associant avec un fragment de peptide de l'antigène, présentée ensuite à la membrane.
OpsonineTerme générique, toute molécule se liant à une substance étrangère et la marquant pour qu’elle soit phagocytée.
FibronectineProtéine se fixant à la surface d'une bactérie, reconnue par les intégrines des neutrophiles ou macrophages pour la phagocytose.
NADPH oxydaseProduit de l'H2O2 à partir de NADPH et O2. Puissant désinfectant, détruit les bactéries dans les phagosomes.
MyéloperoxydaseProduit de l'HClO (eau de javel) à partir de Cl-, H+ et H2O2. Puissant désinfectant, détruit les bactéries dans les phagosomes.
YersiniaBactérie injectant à travers la membrane du macrophage une exotoxine désorganisant le cytosquelette d'actine et provoquant l'apoptose.
GTPySAnalogue non hydrolysable du GTP, utilisé par la dynamine pour former un long anneau.
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Appareil sécrétoire

Question Answer
SRPSignal Recognition Particle, protéine reconnaissant la séquence signal et pouvant se lier au récepteur associé au translocon. Utilise du GTP.
Signal peptidaseProtéine associée au translocon, clive la séquence signal dans la lumière du RER.
STASéquence Stop Transfer Anchor, permet le transfert de cette région dans la membrane du RER et arrête la translocation (la protéine continue d'être synthétisée dans le cytosol).
SASéquence Signal Anchor, permet le transfert de cette région dans la membrane du RER sans arrêter la translocation (la protéine continue d'être synthétisée dans le RER).
PDIProtein Disulfide Isomerase, stabilisant les ponts disulfure dans le RER.
Glutathion (GSH)Tripeptide (E-C-G) possédant une activité réductrice dans le cytosol (5 mM). Note, E est lié à C par le COO- de sa chaîne latérale.
ERADEndoplasmic Reticulum-Associated Degradation, proteasome dégradant (dans le cytosol) les protéines malformées, après ubiquitination.
Prolyl-lysyl hydroxylaseEnzyme catalysant l'hyrdoxylation des prolines et lysines du collagène dans le RER. Nécessite la vitamine C.
Cross-linkingStabilisation de la structure paracrystalline du tropocollagène par des liens intermoléculaires (P ou K-OH*NH3-K) après sécrétion dans l'espace extracellulaire.
DolicholLong lipide membranaire présentant une chaîne glycosylée transférable à une protéine en cours de synthèse.
CalnexineProtéine chaperone présente à la face interne de la membrane du RER, pouvant interagir (comme la lectine) avec les chaînes glycosylées des protéines en cours de synthèse.
CalréticulineProtéine chaperone présente dans la lumière du RER, pouvant interagir (comme la lectine) avec les chaînes glycosylées des protéines en cours de synthèse.
MMPMatrix MetalloProteinase, protéases utilisant un ion Zn2+ pour dégrader des protéines dans le milieu extracellulaire (collagénase, gélatinase…).
KDELRécepteur reconnaissant un signal sur une protéine dans le Golgi, entraînant son transfert (vésicule COP 1) vers le RER (rétention / recapture).
MucinesO-glycoprotéines très hydrophiles libérées au pôle apical de la cellule, permettant de produire un mucus hydraté fluide.
HéparineAnticoagulant constitué d'héparanne-sulfate, GAG très hydrophile et très chargé.
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